Setelah direkrut secara tidak sengaja, Ejen Ali yang berusia 12 tahun menerima perannya sebagai mata-mata MATA dan satu-satunya master IRIS sekarang. Namun tanpa sepengetahuan Ali, MATA sedang mengembangkan versi baru IRIS yang ditingkatkan, IRIS Neo. Ketika IRIS Neo mulai digunakan untuk semua agen, Ali mulai mempertanyakan kegunaannya bagi MATA. Ia didekati oleh orang misterius bernama Niki yang mengaku mengetahui keberadaan orang tuanya yang hilang. Mempertaruhkan kesetiaannya kepada MATA, Ejen Ali kini akan memulai pengejaran mendebarkan untuk mengungkap kaitan misterius tersebut.
